Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm8814-201ENSMUST00000119072 535 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm12318-201ENSMUST00000121235 273 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm7784-201ENSMUST00000180769 989 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Fkbp3-202ENSMUST00000220730 579 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 AC124686.1-201ENSMUST00000225546 522 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ccr6-206ENSMUST00000180103 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 4930480K15Rik-201ENSMUST00000162121 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Cnpy4-202ENSMUST00000110934 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm36426-201ENSMUST00000222903 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Osbpl3-203ENSMUST00000114466 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm13914-201ENSMUST00000118202 991 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm2666-201ENSMUST00000160587 891 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm44426-201ENSMUST00000204258 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 1700017D01Rik-201ENSMUST00000025635 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Olfr1279-201ENSMUST00000090329 942 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Folr2-201ENSMUST00000094141 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Hip1-210ENSMUST00000212301 1625 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rad18-203ENSMUST00000113180 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 C820005J03Rik-201ENSMUST00000195997 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 2610042L04Rik-202ENSMUST00000165466 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Olfr31-201ENSMUST00000100872 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Swi5-202ENSMUST00000113395 712 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm29434-201ENSMUST00000187426 260 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm31373-201ENSMUST00000194403 737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm7356-201ENSMUST00000186636 1527 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm7358-201ENSMUST00000189454 1527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Zfp53-201ENSMUST00000076664 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gp1ba-201ENSMUST00000055184 2710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Cab39l-206ENSMUST00000225595 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Crp-201ENSMUST00000038495 1695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Tex48-202ENSMUST00000102862 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Xlr4c-203ENSMUST00000114530 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rps10-ps4-201ENSMUST00000120308 492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Olfr126-201ENSMUST00000174139 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm4307-201ENSMUST00000177945 910 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm42786-201ENSMUST00000202357 280 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm4303-201ENSMUST00000218922 910 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm4305-201ENSMUST00000219159 910 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 AC124709.2-201ENSMUST00000227710 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ctf2-202ENSMUST00000206038 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms