Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 C820005J03Rik-201ENSMUST00000195997 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Arhgap25-203ENSMUST00000113637 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Apex2-203ENSMUST00000112720 4742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Pla2g5-202ENSMUST00000102511 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm3466-201ENSMUST00000181797 1192 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm30873-201ENSMUST00000207512 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbdsP70122 4930556L07Rik-201ENSMUST00000134422 1490 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Bcl2l14-202ENSMUST00000111960 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 AC140393.1-201ENSMUST00000227959 1581 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Lrrc14b-201ENSMUST00000022064 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Ptpn20-201ENSMUST00000022508 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Drosha-201ENSMUST00000090292 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Hdac7-206ENSMUST00000119670 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 G6pc-201ENSMUST00000019469 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Drc3-203ENSMUST00000108722 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Slc25a14-204ENSMUST00000134257 1805 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Disp1-202ENSMUST00000171366 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SbdsP70122 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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