Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm45437-202ENSMUST00000211418 694 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms