Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Shisa5-204ENSMUST00000196954 843 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8143-201ENSMUST00000203654 1186 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mrgprb4-201ENSMUST00000094388 1219 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Atpaf1-202ENSMUST00000175725 996 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-65-201ENSMUST00000198790 349 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gtpbp6Q3U6U5 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms