Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Epb42P49222 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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