Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Uspl1-206ENSMUST00000122160 3827 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Ctns-201ENSMUST00000006103 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm45330-201ENSMUST00000209681 1575 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm17090-201ENSMUST00000171768 490 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm45349-201ENSMUST00000210285 1074 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 AC160991.1-201ENSMUST00000224924 753 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Ints10-204ENSMUST00000110242 4250 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Arhgap25-203ENSMUST00000113637 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Tomm40l-201ENSMUST00000005817 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Epha5-203ENSMUST00000113399 5166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Zmiz2-202ENSMUST00000102914 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Pou4f1P17208 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms