Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Gm10390-201ENSMUST00000180812 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Slc25a44-201ENSMUST00000057935 3577 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Atg16l1Q8C0J2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 CT010486.2-201ENSMUST00000224003 2714 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Apol7b-201ENSMUST00000089469 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Atg16l1Q8C0J2 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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