Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm16958-202ENSMUST00000181792 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 1700125H20Rik-201ENSMUST00000018623 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Epb42P49222 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Epb42P49222 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms