Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Itgb1P09055 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Fhl3-202ENSMUST00000106199 1139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm12168-201ENSMUST00000119051 368 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm8203-201ENSMUST00000173192 387 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm16008-203ENSMUST00000181389 480 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 AC158122.1-201ENSMUST00000227398 673 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm16131-201ENSMUST00000131007 659 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Atp5h-208ENSMUST00000180072 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm17250-201ENSMUST00000180494 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 A830005F24Rik-201ENSMUST00000065465 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm10250-201ENSMUST00000090488 482 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms