Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Hnrnpc-202ENSMUST00000164655 2843 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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