Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Arhgap10-203ENSMUST00000210922 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm11513-201ENSMUST00000138855 751 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm5266-201ENSMUST00000187302 1162 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Olfr1229-201ENSMUST00000099788 1019 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Siglech-203ENSMUST00000121492 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm28988-201ENSMUST00000191363 1897 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ddhd2-201ENSMUST00000033975 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Mpp2-201ENSMUST00000017458 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Smim7-203ENSMUST00000167290 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Polr3f-202ENSMUST00000110017 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Mfap3l-201ENSMUST00000034066 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm17090-201ENSMUST00000171768 490 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 4931431B13Rik-202ENSMUST00000205646 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SbdsP70122 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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