Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Rnf111-202ENSMUST00000113595 4735 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Rnf111-207ENSMUST00000215848 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Rian-213ENSMUST00000182981 1219 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm27203-201ENSMUST00000183677 307 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6F6VAN0 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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