Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Hdac7-206ENSMUST00000119670 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Nat8f5-201ENSMUST00000032074 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Smoc1-203ENSMUST00000129362 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Slc5a4a-201ENSMUST00000020450 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Txndc16-209ENSMUST00000153383 3691 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 AC138284.4-201ENSMUST00000216704 2882 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm42777-201ENSMUST00000196026 3603 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Rexo5-203ENSMUST00000106520 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Zbtb37-205ENSMUST00000171748 2141 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Tmprss11d-201ENSMUST00000031175 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Gm18638-201ENSMUST00000211293 1773 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms