Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm45349-201ENSMUST00000210285 1074 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 AC123731.1-201ENSMUST00000227417 1403 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm44095-201ENSMUST00000204631 1931 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm36426-201ENSMUST00000222903 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rnf111-202ENSMUST00000113595 4735 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rnf111-207ENSMUST00000215848 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm2897-201ENSMUST00000166494 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm3411-201ENSMUST00000170104 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Arid3b-201ENSMUST00000004780 3785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm12826-201ENSMUST00000121841 379 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 CT009757.1-201ENSMUST00000222801 738 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Adgrl3-219ENSMUST00000122356 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Zfp287-203ENSMUST00000128370 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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