Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cldn34c1-202ENSMUST00000113348 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rab5b-201ENSMUST00000000727 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Timeless-206ENSMUST00000105245 4402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Sms-201ENSMUST00000112529 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 H6pd-202ENSMUST00000084117 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 D930048N14Rik-201ENSMUST00000064493 3426 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Etos1-201ENSMUST00000057134 2015 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm37464-201ENSMUST00000192431 2220 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Xntrpc-202ENSMUST00000094129 4150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Srgap1-202ENSMUST00000081688 7787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Sec23ip-201ENSMUST00000042942 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm32023-201ENSMUST00000220168 661 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Atxn1-202ENSMUST00000167708 3751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Bcas1-201ENSMUST00000013667 2916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm37699-201ENSMUST00000194753 3338 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Nim1k-201ENSMUST00000178142 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms