Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms