Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm10790-202ENSMUST00000221285 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Rnf111-202ENSMUST00000113595 4735 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Rnf111-207ENSMUST00000215848 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm16059-201ENSMUST00000135583 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm33940-201ENSMUST00000209205 1601 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Aqp4-201ENSMUST00000079081 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Cdc25b-202ENSMUST00000079857 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Rps19-ps3-201ENSMUST00000116174 426 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 2310026L22Rik-201ENSMUST00000146658 400 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm20611-201ENSMUST00000177492 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm27605-201ENSMUST00000184648 136 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Klk1b4-201ENSMUST00000077354 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Ebf3-205ENSMUST00000209578 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Rint1-201ENSMUST00000030852 3298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Rufy4-201ENSMUST00000080167 2306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H2-Eb1P04230 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms