Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm37521-201ENSMUST00000193177 2045 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Ubash3b-206ENSMUST00000151485 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm16059-201ENSMUST00000135583 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm20371-201ENSMUST00000203354 1756 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gstm1-202ENSMUST00000126593 828 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 1700063K16Rik-202ENSMUST00000191341 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Fam110c-201ENSMUST00000041133 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Ces1b-201ENSMUST00000109582 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Scml2-202ENSMUST00000074802 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q8BGC1 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Lonp2-203ENSMUST00000122188 2372 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Sag-201ENSMUST00000077772 1719 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Brd9-201ENSMUST00000099384 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Hnrnpc-202ENSMUST00000164655 2843 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm8606-201ENSMUST00000121482 888 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 2310026L22Rik-201ENSMUST00000146658 400 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Itgb6-201ENSMUST00000028348 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q8BGC1 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms