Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Sell-202ENSMUST00000097491 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Ccdc146-201ENSMUST00000030552 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Aqp8-202ENSMUST00000098056 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Mir378b-201ENSMUST00000175244 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 AC107369.2-201ENSMUST00000226154 916 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Mipol1-205ENSMUST00000145003 1424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Ccser2-203ENSMUST00000182042 1420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Btn2a2-202ENSMUST00000110432 2089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 AC164437.1-201ENSMUST00000227321 2308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm1979-201ENSMUST00000168875 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm14182-201ENSMUST00000119334 210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Fuom-202ENSMUST00000120034 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm7545-201ENSMUST00000182773 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm46188-201ENSMUST00000219927 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Snx6-204ENSMUST00000218934 1441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Sntg1-202ENSMUST00000115488 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Ica1l-205ENSMUST00000189776 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm12014-201ENSMUST00000120164 1620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm18345-201ENSMUST00000200710 1390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm29572-201ENSMUST00000190305 283 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm32567-201ENSMUST00000211244 682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Defb6-201ENSMUST00000063112 323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Rasgrp1-203ENSMUST00000172901 1903 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cux1P53564 E030025P04Rik-201ENSMUST00000106710 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms