Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zfp507-201ENSMUST00000061586 6693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ube2l3-202ENSMUST00000115699 2906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ccnd1-201ENSMUST00000093962 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cyp2d22-201ENSMUST00000023083 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 9330104G04Rik-202ENSMUST00000205647 1943 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Slc7a9-202ENSMUST00000118383 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm13302-201ENSMUST00000119405 1849 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cnga3-204ENSMUST00000195272 2197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Phc2-203ENSMUST00000106080 3885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Prpf31-206ENSMUST00000179769 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Syt17-201ENSMUST00000081574 2764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mc1r-201ENSMUST00000098324 3638 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Nr1h4-202ENSMUST00000105296 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Trpm1-202ENSMUST00000177102 2928 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm37266-201ENSMUST00000193802 2287 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr601-202ENSMUST00000210431 2266 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms