Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm7356-201ENSMUST00000186636 1527 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm7358-201ENSMUST00000189454 1527 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm28857-201ENSMUST00000188068 425 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Csf2rb-201ENSMUST00000096355 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm45193-201ENSMUST00000204686 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ccna1-201ENSMUST00000029368 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms