Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Six6-201ENSMUST00000021519 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Dnajb13-204ENSMUST00000207405 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Slco4c1-201ENSMUST00000071985 4908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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Pou4f1P17208 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pou4f1P17208 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms