Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrit3W8DXL4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms