Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3238W4VSP7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3238W4VSP7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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