Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm28036V9GXJ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28036V9GXJ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28036V9GXJ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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