Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Robo3Q9Z2I4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Robo3Q9Z2I4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms