Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd2Q9Z2E1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd2Q9Z2E1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms