Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr1Q9Z2C4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms