Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rlbp1Q9Z275 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rlbp1Q9Z275 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rlbp1Q9Z275 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rlbp1Q9Z275 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rlbp1Q9Z275 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rlbp1Q9Z275 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rlbp1Q9Z275 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rlbp1Q9Z275 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rlbp1Q9Z275 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rlbp1Q9Z275 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rlbp1Q9Z275 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rlbp1Q9Z275 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms