Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn6Q9Z262 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn6Q9Z262 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms