Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne2Q9Z238 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccne2Q9Z238 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccne2Q9Z238 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms