Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z210

Pex11b, Peroxisomal membrane protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex11bQ9Z210 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Pex11bQ9Z210 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex11bQ9Z210 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Pex11bQ9Z210 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Pex11bQ9Z210 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pex11bQ9Z210 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms