Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ilf3Q9Z1X4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms