Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfrp4Q9Z1N6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfrp4Q9Z1N6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms