Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek4Q9Z1J2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nek4Q9Z1J2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms