Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cpne6Q9Z140 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne6Q9Z140 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne6Q9Z140 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms