Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp5Q9Z131 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3bp5Q9Z131 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3bp5Q9Z131 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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