Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pmfbp1Q9WVQ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pmfbp1Q9WVQ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms