Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp46a1Q9WVK8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp46a1Q9WVK8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms