Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ArcQ9WV31 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArcQ9WV31 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms