Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn3Q9WUK7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms