Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pus1Q9WU56 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pus1Q9WU56 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms