Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scnn1bQ9WU38 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Scnn1bQ9WU38 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scnn1bQ9WU38 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms