Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Plod1Q9R0E2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plod1Q9R0E2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plod1Q9R0E2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms