Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Wdr54Q9R0D8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Wdr54Q9R0D8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms