Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ripk3Q9QZL0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ripk3Q9QZL0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms