Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ercc4Q9QZD4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc4Q9QZD4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc4Q9QZD4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms