Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clic4Q9QYB1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clic4Q9QYB1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clic4Q9QYB1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms