Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pcsk1nQ9QXV0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk1nQ9QXV0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms