Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXU7

Prok2, Prokineticin-2, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok2Q9QXU7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prok2Q9QXU7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prok2Q9QXU7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prok2Q9QXU7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prok2Q9QXU7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prok2Q9QXU7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms